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来自远古的讯息(Telostmauscrits) (1 / 4)

作者:月壳表面 最后更新:2022/12/31 12:46:00
        冬日的暖yAn穿过研究室的窗户照到玛修背上,无视室外零下十二度低温的事实蒸着微微暖意。玛修左手食指轻敲上午刚刚送来的y碟外包装,右手食指蜷曲着用第二节指节撑着颧骨末端,右手拇指则g住他外扩的下颔。他盯着眼前的双萤幕,因为一再出现的一组数字微微皱起眉头。

        y碟里的资料是他先前委托外包厂商,进行斑马鱼基因定序的成果。因为基因样本量很少,厂商会先将原本的DNA样本用酶切断、进行聚合酶链式反应PCR後才定出序列。因此玛修收到的资料是数万,甚至数百万串不等长、由代表不同硷基对的字母排列而成的字串。他必须将这些零碎的字串b对拼贴,最後现出序列原本的样貌。

        不过这并不是让他皱眉的原因。定序的技术和重组字串的方法已经非常成熟了。像斑马鱼这种被研究透彻的模式动物,要出大纰漏并不容易。

        让他感到担忧的事情是斑马鱼粒线的基因序列长度和线虫的一模一样。

        当然不是指原始序列本身的长度一模一样。相较於细胞核的基因序列,粒线T的基因序列突变得更快,而且突变速率稳定,时常被用来评估生物的演化进程以及物种间的亲缘关系。线虫和斑马鱼两种生物天差地远,牠们粒线T的基因序列自然不同。

        问题出在玛修手边的理论。他正在研究粒线T基因序列的突变与演化。如果粒线T的内共生假说──我们的真核生物祖先在二十亿年前收服了一种原核生物当「小弟」──是正确的,那麽现在所有生物的粒线T硷基排列应该都源自同一条序列。由此,玛修和他的导师正着手建构一种演算法,希望能直接从生物当前的粒线T基因序列推算始祖序列的型态,并依照两者之间的差异将各个生物安在演化树上的相对位置──实现生物演化树的大一统。

        可是当玛修完成第一版演算法,并且尝试代入资料库中的已有的粒线T基因序列资料,他发现每种生物最後给出的始祖序列长度都一样──12,317±1对硷基。

        不只线虫和斑马鱼,果蝇、文昌鱼和小鼠都一样。现在就连使用他们实验室自己培育的斑马鱼的基因序列进行分析,结果也还是完美的12,317对硷基。

        完美的结果难道不完美吗?

        当然不!玛修用的方法看来复杂华丽,可是脱不出成山的假设和它外cHa的本质。不同的物种应该要得出大致相同但细节迥异的结果。不停出现同一组数字,在同侪审查中只会被视为程式码出错的徵兆。

        不过他已经花了三个月,一行一行、一字一字检查他的程式码不下数遍。他甚至邀请了国外另一间大学的研究团队依据他的理论进行研究,由文化背景迥异的研究员从头实现一次演算法,得出的结果还是一模一样。

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