累职南京兵部职方郎中，后调任浙江出任台州知府，谭纶训练了一千人名乡兵，分配明确，进止整齐划一，不久就成为精锐部队。
倭寇围攻台州，没有攻克只得离去。倭寇转而侵犯仙居、临海，谭纶将他们全部擒拿、斩杀，以而升任浙江巡海道副使。
倭寇从象山冲击台州，谭纶在马岗、何家石览接连打败他们，又与戚继光一起在葛埠、南湾打败倭寇，被加封为浙江布政司右参政。
只是父亲去世的噩耗传来，谭纶只好离职返回江西。
不过在守丧之时，又遇到朝廷出兵讨伐张琏，朝廷用谭伦统领浙江兵讨伐饶平的乱贼林朝曦，事后向朝廷请辞归家守孝。
若是任命谭纶为福建巡抚，既能削短福建巡抚空置的时间，又能有效地给福建一个有军事才能的领导者，可谓是一举两得。
却不管哪股势力想要安排自己的人，但在这大事大非面前，众人对于启用谭纶都没有任何的异议。何况，福建巡抚似乎成为了烫手山芋。
当然，谭伦现在守孝在家，朝廷想要启用他出任福建巡抚，必然要征得嘉靖的同意才行。
令人无奈的是，谭伦的事情还没有定调，有人的矛头便迫不急待地指向了吴山。徐阶从户部拿到粤盐的税收文书后，便直接奔着万寿宫而去。
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