然而好景不长，隋炀帝临幸扬州，宇文化及弑君谋逆，杀了隋炀帝，自立为帝，宇文家与杨家血海深仇，不共戴天。及至宇文化及败于窦建德，仓惶逃命，南阳公主及其子便落入窦建德之手。
窦建德将所有俘虏的宇文家人全部杀掉，因为南阳公主的儿子宇文禅师亦是宇文家的血脉，所以在斩首之列。窦建德派武贲郎将于士澄对南阳公主说：“宇文化及躬行弑逆，人神所不容，现在将族灭其宗。公主之子，法当从坐，若不能割爱，亦听留之。”您若是坚持，自然也可以不杀的。
南阳公主哭着说：“武贲既是隋室贵臣，此事何须见问？”
宇文化及弑君，与南阳公主有杀父之仇，国仇家恨，此生已然不共戴天，自己的儿子乃是宇文家的血脉，自然应当赴死。
然后宇文禅师便被杀了……
后来宇文化及又打了回来，击败窦建德，救出南阳公主，宇文士及前去相见，南阳公主愤然拒绝了他，说：“我与君是仇家，只恨不能手刃君，只是因为令兄谋逆之际，君并不预先知情罢了。”于是宣布与宇文士及断绝关系，严厉的叫他赶快离开。宇文士及仍然请求，南阳公主愤怒的说：“你一定想死的话，就可以进来见我。”
宇文士及见她说的这样坚决，知道说服不了她，于是洒泪离去……
后来宇文士及归顺大唐，李二陛下将宗室之女许配给他，生下了一个儿子宇文阐提，一个女儿宇文修多罗，已然与李二陛下第十三子赵王李福定下亲事。
“阐提”乃是佛教用语，意为“指永远不得成佛的根机”，即是指心中之孽缘，可见宇文士及依旧对南阳公主耿耿于怀，不能释然。
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