樱木功在欧洲长到青年时期,就加入了教会,做神父的助手，不过樱木功却利用在忏悔室听到的事去敲诈勒索当事人，被神父赶走后，又在欧洲不止一个地方做了同样的事,也算是恶名昭着,之后才辗转来到了江神原。
同时，警方也趁着樱木功被叫到伊丽莎白家的期间,在教堂一个房间里,找到了樱木功袭击池非迟、三浦丈次时穿的黑袍，还有伪装烧伤面容的面具。
樱木功一看证据确凿，没有再辩驳，承认是自己杀人。
半年前,樱木功听说伊丽莎白病倒了，从欧洲来到江神原,因为在欧洲做的事，自身已经被通缉，所以没有跟伊丽莎白相认，以神父的身份待在教堂，经常来探望伊丽莎白,而在那个时候,元町清三在忏悔室里说起了索菲亚的死,让樱木功知道了当年的真相。
索菲亚是在家里浇上汽油,点火后自己走进大火中的，那一晚，元町清三、户田次郎、伊势崎力组成的少年侦探团在调查索菲亚,目睹了索菲亚自杀的全部经过,却没有阻止，在火势大起来之后，就慌张地跑回了家里。
三人为此而愧疚了一辈子，不过这也被樱木功怨上了。
在伊丽莎白死后，樱木功以为三人会因为愧疚而拒绝继承遗产，没想到三人却不放弃继承，让樱木功认为三人都是表面为人做事、背地里狼心狗肺的人,这才起了杀机，并决定杀死遗嘱上那些排在前面的继承人。
柯南又以毛利小五郎的身份,揭露了樱木功是鹤见叶子亲生父亲的事，说出了樱木功本来是想让鹤见叶子继承伊丽莎白的遗产。
随后，目暮十三又拿出了去医院调查时、伊势崎力给警方的笔记本,叹息着念出了上面的内容。
原来伊势崎力已经知道了鹤见叶子的身份，也知道了樱木功的身份，而元町清三、户田次郎也相继知道这件事,三个人商量之后，决定用性命来偿还曾经对索菲亚寻死坐视不管的过错，让樱木功完成复仇，才没有在当时放弃遗产继承。
“……至于我的儿子真秀，我打算力劝他继承伊丽莎白女士的遗产，这样一来，我们的死，加上真秀放弃继承遗产，那么伊丽莎白女士的遗产，就能自然地让有他们家血统的鹤见叶子小姐继承了吧……”目暮十三念完之后，合上了笔记本，看着脸色苍白的樱木功道，“第一个被杀害的户田先生，在收到恐吓信之后，并没有报警，之后的元町先生也是一样，还一直跟我们说那是恶作剧，我们去医院找伊势崎力先生了解情况时，他也说自己对凶手没有头绪，他们全都在配合你完成复仇。”
“怎……怎么会这样？不可能，绝对不可能！”樱木功站在沙发前，眉毛倒竖，情绪激动地骂道，“他们始终都是自私自利、老奸巨猾、心术不正的卑鄙小人，他们一直戴着三圣人的面具欺骗着江神原的人们啊！”
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